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次のステップ

現在のガイドラインはeDNAデータのFAIR性を大幅に向上させると考えていますが、他の貢献も大きな違いを生みます。

意識向上

次のステップは、FAIR原則、既存ガイドライン、および利用可能なツールについてeDNAコミュニティへの周知を図り、その採用を促進することにあります。この目的のため、筆頭著者は今後1年間でeDNA実務者向けにワークショップを開催し、FAIRデータ原則の紹介や標準化されたフォーマット手順の実践的な導入ガイダンスを提供する予定です。最初のワークショップは2025年2月にニュージーランド・ウェリントンで開催されたeDNAカンファレンスで実施されました。これらのワークショップは単なる研修にとどまらず、直接の対話を構築し、コミュニティのニーズを特定し、ワークフロー内でFAIRデータ実践を採用する際の課題に対処するために極めて重要です。このステップは特に重要で、オープンでFAIRなデータはeDNA実務者の協力と、より広く利用可能にするという彼らのコミットメントに依存するためです。

いくつかの研究はオープンサイエンス行動を調査し、科学者の間に存在する障壁を特定しています(例:Norris and O’Connor, 2019;Tenopir et al., 2015)。これらの障壁には、標準やツールの欠如、必要なデータ管理システムを扱うための時間やスキル不足などの技術的・資源的制約が含まれます(Tedersoo et al., 2021;Tenopir et al., 2015)。さらに、他者にとってのデータの価値を認識していない、誤りの指摘を恐れる、限られた研究資源のもとで資金獲得に大きな努力を注いできたため公開に抵抗がある、既存の慣行を変えたくない等の認知的障壁も存在します(Norris and O’Connor, 2019;Tenopir et al., 2015)。

これらの課題に対処するには、再現性や記録保持を超えたデータ共有の多様な利点を伝えることが重要です。公共の利益やデータ再利用を可能にすることに加え、データ提供者にとっても多くの利点があります。例えば、関連研究の可視性や引用数の増加(Colavizza et al., 2020;Piwowar et al., 2007;Wood-Charlson et al., 2022)、データベース経由でアクセスされたデータの直接的な引用指標(例:GBIF)、共同研究や共著の増加などがあり、これらは専門的地位の向上につながります(Bethlehem et al., 2022;McKiernan et al., 2016;Piwowar and Vision, 2013;Whitlock, 2011)。しかし多くのeDNA実務者はまだこれらの利点を十分に認識していません。ワークショップを通じて彼らと直接・開かれた対話を築くことで、彼ら特有の障壁やニーズを明らかにし、協働で解決策を構築し、コミュニティ内でFAIRデータ実践の文化を育むことができます。

ガイドラインの改訂・更新・統合

eDNA科学は比較的新しく急速に進展しているため、新しい方法や技術が登場します。FAIReメタデータチェックリストとフォーマットガイドラインを改善し、関連性を保つためには定期的な改訂と更新が不可欠です。データ提供者や再利用者からの意見はこのプロセスにとって非常に重要であり、随時フィードバックを歓迎します。参加方法の詳細は「How to contribute」をご覧ください。更新されたガイドラインは https://fair-edna.github.io で公開されます。

共著者ネットワーク(例:GSC、TDWG、ENA、GBIF、OBIS、ALA)を活用し、FAIReメタデータチェックリストを既存のデータ標準やデータベースと統合するために継続的に改訂・共開発していくことを目指します(図6)。FAIRe手順とフォーマットの実装および整合は、DNA由来の生物多様性データ公開に関する既存ガイドラインへの貢献(Abarenkov et al., 2023)や、FAIRe-atorやFAIRe2GBIFのようなスクリプト、GBIF MDTのようなツールの開発を通じて支援されます。FAIReチェックリストをGSCのスイート(すなわちMIxS)に組み込み、INSDCシステム内での採用を容易にする取り組みは、GSC MIxS Compliance and Interoperability Working Group(CIG)およびTDWGからの意見を得ながら進められます(図6)。

TDWGとGSC間での配列ベースの生物多様性データに関する仕様開発の協力合意の枠組みのもと、FAIReチェックリストをDwC DNA Derived Data拡張に統合することを支援します。これらの組織の目的と整合させるための継続的な改訂、テスト、および整合作業が必要です。重要なマイルストーンには、DNA由来生物多様性データの公開に関する更新ガイドラインの公表(Abarenkov et al., 2023)、eDNA MIxSチェックリストの公表、FAIReに整合したDwC DNA Derived Data拡張の公表が含まれます。これらのマイルストーンの達成は、FAIReチェックリストが妥当でありeDNAコミュニティに受け入れられていることの証拠となります。長期的な維持管理は理想的にはこれらのコンソーシアムや組織によって行われるべきですが、FAIReチェックリストへの持続的な関与とeDNA科学コミュニティからの関心が必要です。

我々は現行ガイドラインを学術誌の出版要件に組み込むことに大きな関心を持って開発しました。Wiley社およびEnvironmental DNA誌と協働し、出版手続きへFAIRデータ原則を統合するロードマップを作成しました。このロードマップは3つの主要ステップを含みます:1) 論文掲載時にFAIReガイドラインの順守を強く推奨する、2) 適切な時期に順守を必須とする、3) これらの要件をMolecular EcologyやEcology and Evolutionなどの他誌にも拡大する。ほとんどの学術誌はデータ共有を義務付けていますが、FAIRな形でデータを提出することはまだ広く行われていません(Roche et al., 2015)。FAIRデータガイドラインの実装は、毎年多数のeDNA研究が発表され、それらが生成する膨大な遺伝情報と種の出現データを考えると、極めて重要かつ効果的な戦略です(Takahashi et al., 2023)。

Figure 6. FAIRe roadmap
Figure 6. FAIReチェックリストとガイドラインの継続的発展のロードマップ。時間は左から右へ進行し、星は現在地点を示す

FAIRとCAREの調和

CARE原則(Collective benefit、Authority to control、Responsibility、Ethics)は、先住民族のデータに関する権利と利益を保護するためにGlobal Indigenous Data Allianceによって開発されました。これには資源や環境、伝統知識に関する情報・データが含まれます(Carroll et al., 2021, 2020)。人々と目的に焦点を当てたCARE原則は、先住民族の主権を中心に据えつつデータ指向のFAIR原則を補完するよう設計されています(Mc Cartney et al., 2023)。FAIRデータイニシアティブにCARE原則を実装することは、データ利用が先住民族の権利を尊重し、有意義な目的に資すること、そして先住民族および地域コミュニティ(IPLC)の福祉を促進することを保証するために不可欠です(Carroll et al., 2021;O’Brien et al., 2024)。

Mc Cartney et al.(2023)は、CARE原則に従った真核生物由来の配列データのライフサイクルに関するロードマップを示しました。これは、研究者が各研究段階でIPLCと持続可能なパートナーシップを構築するために必要な行動を特定するものです。FAIRイニシアティブの文脈では、文化的に配慮した連結メタデータを開発することが重要です。例えば、文化的に重要な場所の座標のような機微なデータを一般化したり、公開しない(withhold)ことは尊重され受け入れられるべきであり、これはFAIReメタデータチェックリストや他の標準・データベースにおける dataGeneralization や informationWithheld といった用語で記録できます(Darwin Core Maintenance Group, 2021;Chapman, 2020)。アクセス、使用許可、ならびにデータ権利を所有・管理する個人または組織に関する情報は、各プロジェクトの開始時に定義し、accessRights や rightsHolder の用語の下で記録するべきです。さらに、従来知識ラベルと通知(Traditional Knowledge Labels and Notices)の文脈メタデータ(Liggins et al., 2021;“Local Contexts – Grounding Indigenous Rights,” 2023)、場所と人々に関する出自情報(Mc Cartney et al., 2023)、および種の文化的重要性(Reyes-García et al., 2023)を記録するためのさらなる作業が必要です。会議、ワークショップ、およびIPLCやeDNAコミュニティを含む様々な利害関係者との協働は、eDNAデータ共有の多面的な利点を認識し、情報交換や議論を促進するために不可欠です。これらすべての取り組みは、FAIRとCAREを調和させ、人と自然との結びつきを確立・維持し、知識移転、能力開発、双方向の科学、そして生物多様性保全の手段として機能するために重要です。